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雅酶丨磁珠:蛋白互作小幫手

前言

作為科研“達人”,“蛋白與蛋白的相互作用”這一課題想必大家都很熟悉。研究這一課題的套路很多,這里我們重點聊一聊磁珠在這方面的應用。


磁珠的結構


磁珠是一類具有超順磁性的磁納米粒子。所謂超順磁性,是指磁珠在外磁場的作用下具有弱磁性,容易被吸附,撤去磁場后沒有剩磁,容易被分散。


磁珠的結構一般包含磁性的內核(通常為鐵的衍生物)、具有良好生物相容性的外殼 以及 外殼上偶聯的各種配體(如羧基、氨基等官能團或Protein A/G、抗體等生物大分子)。下圖為羧基磁珠示意圖。

image.png

羧基磁珠示意圖


磁珠之所以能在蛋白互作上大顯身手,突出的特點就是蛋白荷載量高,特異性強,樣品損失小,操作便捷??傊褪呛唵渭臃奖悖?/span>


一般的實驗流程如下

image.png

1. 磁珠與樣品共同孵育,捕獲目的蛋白;

2. 加外磁場吸附磁珠,棄掉上清液;

3. 加入漂洗液漂洗,去掉非特異結合蛋白;

4. 加入洗脫液洗脫,收集目的蛋白。


 如何選擇磁珠?


蛋白純化磁珠常用的配體有Protein A、Protein G、Protein A/G、標簽蛋白抗體、鏈霉親和素蛋白等。

 

Protein A/G磁珠是在磁珠表面偶聯Protein A/G,而Protein A/G能與IgG相結合,因此可以用來純化各種抗體。Protein A/G磁珠也可以通過結合不同的抗體,形成“磁珠-抗體-抗原”復合物,從而捕獲相應的抗原或互作蛋白。

image.png

Protein A/G磁珠工作原理圖


相同工作原理的磁珠還有Protein A磁珠和Protein G磁珠。Protein A和Protein G以及Protein A/G在與不同抗體亞型的結合能力上有所差別,選擇時可以參照下表。Protein A/G由于是Protein A和Protein G抗體識別區域的重組融合蛋白,因此通常在實驗中表現更佳。

image.png

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YJ001

Protein A磁珠

YJ002

Protein G磁珠

YJ003

Protein A/G磁珠


需要注意的是,Protein A能與抗體Fc端特異性結合,Protein G不僅能與Fc端結合,還能低親力與Fab端特異性結合。


所以需要純化抗體Fab端的小伙伴,可以選擇Protein A磁珠特異性去除Fc端,這樣就可以獲得Fab端啦!


另外,我司還提供一種瓊脂糖磁珠,與普通磁珠相比,瓊脂糖磁珠的IgG蛋白荷載量更高,更適合用來純化大量的IgG。


_

YJ101

Protein A瓊脂糖磁珠

YJ102

Protein G瓊脂糖磁珠

YJ103

Protein A/G瓊脂糖磁珠


根據抗原抗體結合的特異性,研究者將抗體直接與磁珠偶聯,獲得抗體偶聯磁珠,如anti-Flag免疫磁珠、anti-Myc免疫磁珠等,可以用來直接捕獲對應的抗原。


與ProteinA/G磁珠相比,抗體偶聯磁珠不用考慮抗體種屬以及亞型的選擇,操作上也少了磁珠和抗體結合的步驟,大大縮短實驗時間。目前大部分磁珠偶聯的抗體為通用的標簽蛋白抗體,包括Flag、HA、Myc、GST、His等,因此更適合用來捕獲外源表達的標簽融合蛋白。

image.png

抗體偶聯磁珠工作原理圖


_

YJ005

Anti-HA免疫磁珠

YJ006

Anti-Myc免疫磁珠

YJ007

Anti-Flag免疫磁珠

YJ008

Anti-GST免疫磁珠

YJ009

Anti-His免疫磁珠

YJ010

Anti-GFP免疫磁珠


還有一種常用的磁珠——鏈霉親和素磁珠,是將鏈霉親和素蛋白(SA)偶聯在磁珠上,依靠鏈霉親和素和生物素(Biotin)的特異性結合,能捕獲被生物素標記的生物大分子,如生物素化蛋白、核酸等。其結合能力比抗原抗體的特異性結合更強。

image.png

鏈霉親和素磁珠工作原理圖


_

YJ011

鏈霉親和素磁珠


 常見問題分析 


01

用Protein A/G磁珠做免疫沉淀試驗(IP)時,沒有捕獲到目的蛋白?

a、檢測體系中目的蛋白是否有表達;

b、細胞裂解液需新鮮制備,加入合適的蛋白酶抑制劑;

c、IP抗體的質量問題。


02

用標簽抗體偶聯磁珠做IP,標簽應該構建在蛋白的N端還是C端?

理論上標簽不管連在蛋白的N端還是C端都可以,前提是標簽蛋白沒有被融合蛋白的三維結構包裹起來,以及不影響目的蛋白的生物學功能。


03

在IP過程中出現非特異性條帶如何處理?

a、減少磁珠與樣品孵育時間;

b、增加漂洗次數;

c、減少樣品總蛋白濃度;

d、如果使用的是Protein A/G磁珠,可以先將樣品與Protein A/G磁珠(不加抗體)孵育30min進行預清除,去除樣品中能和磁珠非特異性結合的雜蛋白。


04

進行Protein A/G磁珠和抗體偶聯磁珠的回收時,需要注意哪些問題?

a、非變性洗脫后的磁珠才能進行回收,如低pH洗脫;

b、回收的磁珠只適合用來重復純化同種抗體或者標簽蛋白;

c、回收的磁珠不建議用來做Co-IP,以免磁珠上殘留的蛋白干擾實驗結果。


05

Protein A/G磁珠和抗體偶聯磁珠回收步驟有哪些?

a、非變性洗脫后的磁珠用低pH洗脫液洗脫3-5次;

b、再用PBS洗3-5次;

c、保存在PBS溶液中,短期內可以重復使用。


06

保存磁珠需要注意哪些問題?

磁珠嚴禁凍結,這會降低磁珠的蛋白結合能力。磁珠置于常溫,性能影響不大,但需及時放回4℃。


磁珠及相關產品目錄


貨號

名稱

規格

價格

YJ001

Protein A磁珠

1mL

748元

YJ002

Protein G磁珠

1mL

748元

YJ003

Protein A/G磁珠

1mL

748元

YJ004

Protein L磁珠

1mL

1128元

YJ005

Anti-HA免疫磁珠

1mL

1838元

YJ006

Anti-Myc免疫磁珠

1mL

1838元

YJ007

Anti-Flag免疫磁珠

1mL

1838元

YJ008

Anti-GST免疫磁珠

1mL

1838元

YJ009

Anti-His免疫磁珠

1mL

1838元

YJ010

Anti-GFP免疫磁珠

1mL

1838元

YJ011

鏈霉親和素磁珠

1mL

1128元

YJ012

伴刀豆球蛋白 A(ConA)磁珠

1mL

748元

YJ101

Protein A瓊脂糖磁珠

1mL×2

1138元

YJ102

Protein G瓊脂糖磁珠

1mL×2

1138元

YJ103

Protein A/G瓊脂糖磁珠

1mL×2

1138元

YJ104

His標簽蛋白純化瓊脂糖凝膠

1mL×10

568元

YJ105

GST標簽蛋白純化瓊脂糖凝膠

1mL×10

848元

YJ106

His標簽蛋白純化瓊脂糖磁珠

1mL×5

918元

YJ107

GST標簽蛋白純化瓊脂糖磁珠

1mL×5

918元

YJ108

Anti-Flag免疫凝膠

1mL

1838元

YJ201

經典Protein A/G免疫(共)沉淀試劑盒

≥40次

1198元

YJ202

基礎免疫(共)沉淀試劑盒(無磁珠)

≥40次

598元

YJ203

經典Protein A免疫(共)沉淀試劑盒

≥40次

1198元

YJ204

經典Protein G免疫(共)沉淀試劑盒

≥40次

1198元

YJ205

HA免疫(共)沉淀試劑盒

≥40次

2198元

YJ206

Myc免疫(共)沉淀試劑盒

≥40次

2198元

YJ207

Flag免疫(共)沉淀試劑盒

≥40次

2198元

YJ208

Flag免疫(共)沉淀試劑盒(凝膠)

≥40次

2198元

YJ209

GST免疫(共)沉淀試劑盒

≥40次

2198元

YJ210

His免疫(共)沉淀試劑盒

≥40次

2198元

YJ211

GFP免疫(共)沉淀試劑盒

≥40次

2198元


雅酶.jpg

拜爾迪生物是雅酶的授權特約經銷商,

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